Browsing by Author "常睿澤"

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琉球蘇鐵之族群遺傳與保育
(2025) 常睿澤; Chang, Jui-Tse
島嶼的空間碎片化以及其過去的陸地變化使之成為研究微演化過程的理想系統。這些時空特性影響物種的拓殖模式與族群大小變化，留下了由漂變所驅動的基因組層級之變異。當島嶼分布於較廣的緯度或海拔梯度時，也會進一步包含較大的環境變異，而促進透過選擇所驅動的基因分化演化出當地適應的族群。這些機制共同促進了島嶼之間的物種或族群多樣性，但同時也限制了它們的地理分佈。在這些島嶼物種中，沿海的物種因將受到來自陸地與海洋的氣候變遷與連帶之災難性威脅而特別脆弱，因此迫切需要保護。此外，島嶼上從族群到物種的漸進分化過程也挑戰了現有的分類系統，凸顯了通過綜合方法重新評估分類的必要性。蘇鐵是物種多樣性高的裸子植物，而於現存的380個物種中有68%面臨滅絕的威脅，因此有迫切保育上的必要。然而，蘇鐵的大型基因組（25-64 pg/2C）對於解構基因組層級的漂變或選擇驅動之分化構成了挑戰。在本論文中，我以東方蘇鐵組為研究對象，包括主要分布於琉球群島沿海及台灣低海拔河岸的台東蘇鐵（Cycas taitungensis C. F. Shen）和琉球蘇鐵（C. revoluta Thunb.），來探討物種形成的地理模式。透過雙限制酶切位點測序（ddRADseq）方法，於全面取樣族群中獲得了基因組層級的變異，進一步整合了形態數據後，再進行分類重新評估。儘管最終將這兩個物種做同物異名處理，但其基因組層級的族群分化顯示台灣內部（包括一個高度分化的隱蔽支系）以及琉球群島的沖繩和奄美之間具有空間上分化的結構。因此，我進一步探討了促進它們各自分化的機制。在台灣方面，鬼基因滲入解釋了同域隱蔽支系的分化，並可能伴隨著與沿海適應和抗病性相關的適應性遺傳變異的轉移。這樣的結果也部分解釋了而於琉球群島方面，由於甲蟲在遠距離基因交流中扮演重要角色，因此我探討了與傳粉性狀有關之毬果揮發性有機化合物。沖繩和奄美之間化學變異與基因組結構的匹配結果揭示了可能的傳粉者促進分化之機制。為進一步了解氣候變遷對各遺傳分群的影響，我先定義了保育單元，並估算了目前的地區適應性及未來在氣候變遷下的遺傳適應不良。接著，揭示了與氣候相關的災難性因子對遺傳適應不良的負面影響。為了理解影響族群分化的地景因素，我進一步探討不同地景模型對遺傳分化的影響。最後，推測了可能的演化拯救途徑。研究結果顯示，位於琉球中部的沖繩和奄美島是最需要保護的區域，其中奄美島將需要通過人為基因交流輔助來應對未來的氣候變遷。