Browsing by Author "賴郁婷"

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    既有遺傳變異對局域適應的重要性 - 探尋台灣粉紅鸚嘴對海拔適應的遺傳基礎
    (2016) 賴郁婷; Lai, Yu-Ting
    近期人類活動正快速地改變全球地貌及氣候型態，促使生物面臨新的選汰壓力。因此，瞭解生物如何因應快速的環境改變，不但是演化生物學的基本問題，也成為生物多樣性保育的重要議題。本研究以海拔適應做為檢測局域適應遺傳基礎的研究系統，並以近期與亞洲大陸族群分化（約四萬年前）且廣泛分布於台灣不同海拔的粉紅鸚嘴（Sinosuthora webbianus bulomachus）作為實驗物種。我先建立一隻雄性粉紅鸚嘴的基因組草圖，再自東西部高（> 2000公尺）與低（< 100公尺）海拔族群中，選取四十隻個體進行基因組重定序（平均定序深度約六倍），利用基因組掃描的方式找尋高低海拔族群局域適應的證據。我們發現107個可能與海拔適應相關的候選區域（candidate regions），且有79個基因落於這些候選區域中或附近，其中有九個基因與供氧階梯（oxygen cascade）、溫度調控（thermoregulation）及防止UV侵害（UV protection）相關。我們在這107個候選區域中，分別於台灣東西邊找到了199個及187個與海拔適應相關的SNP位點，且這些位點大部分與亞洲大陸族群共有（約91%）；此外，這些位點皆落於非編碼區。這些結果顯示，相對於編碼區改變而導致功能上的變化，調控區的改變對於局域適應可能佔有更重要的地位；而既有變異可能是海拔適應的過程中，供應有利遺傳變異的主要來源。本研究除了提供局域適應背後可能的遺傳機制外，也提供我們推測物種能否克服環境變遷的依據。